Instytut posiada majątek trwały o łącznej wartości netto 82 148 102 PLN*, na który składają się:
a) grunty (w tym prawo użytkowania wieczystego gruntu) - 41 026 557 PLN
b) budynki i budowle - 28 986 858 PLN
c) urządzenia techniczne i maszyny oraz aparatura medyczna - 2 041 733 PLN
d) środki transportu - 63 644 PLN
e) inne środki trwałe - 10 029 291 PLN
*Stan na dzień 31.12.2008